新規事業の創造や企業再生の仕組みの構築を目指す学生は、１年次には２科目の特殊講義を選択する。それらは「イノベーション論」と「経営事業創造」で、そこでは事業創造の基本を学ぶ。さらに、必修科目として、主指導教授の「特殊演習I」を履修し、研究のための理論や方法などを学ぶ。２年次には、その研究の幅を広げるため、特殊講義からさらに２科目選択する。「ソーシャル・イノベーション」と「知的情報システム」を選択する。
博士論文の作成には、「研究指導I、II、III」を必修科目として履修し、主指導教員のもとで博士論文の企画、作成、執筆を行う。

地域づくりの仕組みの構築を目指す学生は、１年次には２科目の特殊講義を選択する。それらは「ソーシャル・イノベーション」と「地域マネジメント」である。これらの科目を履修することで地域づくりの基本を習得する。さらに、主指導教員が行う「特殊演習I」を履修し、研究のための理論や方法などを学ぶ。２年次には、さらに研究の幅を広げるために選択科目として特殊講義２科目を選択する。それらは「地域・グローバルイノベーション」と「知的情報システム」で、これらの科目を履修することでより研究の幅を広げることができる。
博士論文の作成には「研究指導I、II、III」を必修科目として履修し、主指導教員のもとで博士論文の企画、作成、執筆を行う。

様々な組織のイノベーション研究を行う研究者志望の学生は、１年次には、選択として、主指導教員以外の教員が持つ特殊演習IIを選択する。それは当該研究分野に関連する演習科目である。たとえば、新規事業創造にかかわる研究の場合、マーケティングにかかわる「特殊演習II」を履修する。必修科目は主指導教員の「特殊演習I」を履修する。２年次には、さらにその研究を高度化するために「特殊演習II」をもう１科目履修する。たとえば、地域開発にかかわる「特殊演習II」である。あるいは、ソーシャル・イノベーションにかかわる研究の場合、地域経営にかかわる「特殊演習II」を履修する。必修科目は主指導教員の「特殊演習I」を履修する。２年次には、さらにその研究を高度化するために特殊演習IIをもう１科目履修する。たとえば、公共政策にかかわる「特殊演習II」である。
博士論文の作成には「研究指導I、II、III」を３年間にわたって履修し、そこで博士論文の企画、作成、執筆を行う。

データサイエンス研究者を目指す学生は、 先ず1年次において主指導教員の「特殊演習I」を履修し、３年間の研究遂行に必要な研究方法を身に付ける。併せて、1年次においては近接の情報システム分野の「特殊演習II」を履修し、知的情報システム分野の理論・方法に関する理解を深める。さらに、２年次には地域マネジメントに関わる「特殊演習II」を履修することにより、データサイエンスの応用先に関する理解を深める。これらの科目を履修し、「研究指導科目I、II、III」において主指導教員の指導のもとに複数の査読論文執筆経験を積み最終的に学位論文を完成させることによって、データサイエンス自体とその応用先に深い見識を持つ研究者を養成する。